کلینیک فوق تخصصی ریه از جمله مهمترین بیمار ی های ریوی و تنفسی که در این مرکز مورد تشخیص و درمان قرار می گیرند، می توان به موارد ذیل اشاره کرد:بیماری های انسدادی از جمله آسم، بیماری انسدادی مزمن ریوی (COPD)، برونشکتازی، فیبروز سیستیک، برونشیولیتاختلالات جریان خون ریه از جمله آمبولی ریوی، هایپرتانسیون ریوی، ادم ریوی، واسکولیتعفونت های ریوی از جمله سل، پنومونی و آبسه ریهتومور ها و بدخیمی های ریه و دستگاه تنفسیبیماری های فضای جنب ریه (پلورا) از جمله تجمع مایع یا هوا در پلورا، عفونت ها و تومور هابیماری های بافتهای بینابینی ریه از جمله فیبروز ریوی ناشناخته (IPF)، التهاب ریوی حساسیتی و سارکوییدوزبیماری های ناشی از عوامل محیطی و شغلیآپنه خوابنارسایی تنفسی و بیمارانی که نیاز به تهویه مکانیکی و مراقبت های بحرانی دارند